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1952年出生于山東濟南一個干部家庭，1958年回故鄉蓬萊范家村，在農村度過了8年的童少年時期，1968年畢業于濟南山東師范學院附中，先后在濟南456廠、中國人民解放軍9637部隊和青島郵電局工作過。

1978年恢復高考后，考入上海復旦大學中文系，1982年畢業分配到北京新華通訊社，1986年到新華社-英國湯姆森基金會國際新聞培訓中心學習，1989年到南京大學--霍普金斯大學中美文化中心進修1993年被新華社世界問題研究中心聘為特邀研究員，1995年調國務院發展研究中心《中國經濟時報》任編委，高級記者，數家研究機構特約研究員，2000年創辦北京大軍經濟觀察研究中心，現任中心主任，研究員。

仲大軍是國內目前知名的經濟觀察家、社會評論家、批評家、專欄作家、政府和企業顧問。由于職業的關系，近年里他著力創建經濟觀察這一職業，根據企業和政府的需求及時做出有指導性和前瞻性的分析判斷。例如 ,他最早寫出“告別短缺經濟”的文章。1997年，他發表“迎接微利時代”一文,較早地指出了中國經濟的這一新特征。1998年初，仲大軍根據中國行業生產的變化寫出了“中國產業利潤大轉移”一文，對產業間利潤轉換的現象首先進行了描述。2000年春，當“新經濟”、“網絡經濟”被炒得甚囂塵上之際，仲大軍撰文指出：“今后十年中國經濟仍然處于‘土木鋼鐵'經濟的時代”。 在當前的中國，仲大軍是一個難得的社會批評家。特立獨行的性格使他不喜歡隨波逐流，他總是站在社會發展的前沿，最先提出社會變化的新動向和新趨勢，他最先寫出加大教育投入、消除教育瓶頸的文章，最早呼吁打破戶籍樊籠，給中國公民以自由遷徙的權利，最早寫出反壟斷的文章，最早對中國城鄉二元結構作出深入研究。這些年里，仲大軍不僅是一個經濟研究工作者，也是一個社會改革家和社會活動家。他廣泛地參入各種研究調查活動，大量地為企業界和各級地方政府做經濟形勢觀察報告，為企業和地區提供發展戰略研究規劃報告，密切注視改革動向，為中國中央政府的改革大業獻計獻策。

仲大軍也是當前國內最有影響的社會問題撰稿人之一，每年有幾百萬字獨立思考的文章見諸國內外報刊雜志，其主要著作有《尋找新思路》、《國民待遇啟示錄——二元結構下的中國》等。