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本名方是民，1967年9月生于福建云霄縣(屬閩南漳州市)。1985年考入中國科技大學生物系。1990年本科畢業后赴美留學。1995年獲美國密歇根州立(Michigan State)大學生物化學博士學位，先后在羅切斯特(Rochester)大學生物系、索爾克(Salk)生物研究院做博士后研究，研究方向為分子遺傳學。定居美國加利福尼亞州，為自由職業者，主要從事網站開發和寫作。 1994年創辦世界上第一份中文網絡文學刊物《新語絲》，主持新語絲網站。1999年4月率先在互聯網上批判法倫功。2000年創辦中文網上第一個學術打假網站“立此存照”，揭露了幾十起科學界、教育界、新聞界等學術腐敗現象，新華社在2002年1月15日、2月23日曾發過兩篇通稿報道，美國《科學》在2001年8月10日曾專文介紹。

曾任《環球》、《科學世界》的專欄作者，定期為《環球時報》、《南方周末》撰稿。目前擔任《中國青年報》、《經濟觀察報》、《長江商報》和《法制晚報》的專欄作者。

著作：《進化新解說》(香港天地圖書公司，1997)，《法倫功解剖》(湖南人民出版社，1999)，《網路新語絲》(主編，河北人民出版社，2000)《方舟在線》(北京理工大學出版社，2000)，《叩問生命》(天津教育出版社，2001)，《進化新篇章》(湖南教育出版社，2001)，《潰瘍--直面中國學術腐敗》(海南出版社，2001)，《長生的幻滅——衰老之謎》(上海科技出版社，2002)，《江山無限——方舟子歷史隨筆》(福建人民出版社，2004)，《餐桌上的基因》(少年兒童出版社，2005)(再版改名《食品轉基因》，2007)，《基因時代的恐慌與真相》(廣西師范大學出版社，2005)，《尋找生命的邏輯——生物學觀念的發展》(上海交通大學出版社，2005)(第二版，2007)，《科學成就健康》(新華出版社，2007)，《批評中醫》(中國協和醫科大學出版社，2007)，《方舟子破解世界之謎》(陜西師范大學出版社，2007)，《方舟子帶你走近科學》(陜西師范大學出版社，2007)，《你在吃補還是吃毒》(臺灣，2008)等17部著作。